Jätteet
Kotieläintuotanto jättää jälkeensä runsaasti sekä orgaanista että epäorgaanista jätettä. Orgaaninen jäte voidaan kierrättää suhteellisen helposti edelleen, mutta esimerkiksi lannan käytössä lannoitteena on monia haasteita mm. riittävän suuren levityspinta-alan suhteen. Lanta ei myöskään sisällä aina tiettyä pitoisuutta esimerkiksi typpeä ja fosforia, jolloin sen oikeaa levitysmäärää ja vaikutuksia ympäristöön on vaikea arvioida.
Jätevedet
Kotieläintuotannossa syntyy runsaasti jätevesiä. Sikaloissa ja broileri- ja kalkkunatiloilla tuotantotilat pestään aina kasvatuserien välissä. Myös teurastamoissa syntyy jätevesiä. Erityisen paljon jätevesiä syntyy kuitenkin maidontuotannossa. Maitotilalla syntyy joka päivä keskimäärin 400 litraa jätevettä lypsykoneiden, tilasäiliöiden ja muun pesemisen seurauksena. Maitohuoneen jätevesissä on runsaasti ravinteita, erityisesti pesuaineiden fosforia sekä maidon orgaanisia aineita. Yleensä nämä vedet johdetaan lietelanta- tai virtsasäiliöön, joskus kunnalliseen puhdistamoon tai tilan omaan jätevedenpuhdistusjärjestelmään, joiden puhdistusteho ei rehevöittävien fosforin, typen, orgaanisen aineksen ja mikrobien osalta ole kovinkaan hyvä. Puhdistamisen jälkeen vedet johdetaan tavallisesti ojiin. Vesistöihin joutuessaan nämä ravinnepitoiset jätevedet aiheuttavat rehevöitymistä.
Muu jäte
Maaseutuelinkeino kokonaisuudessaan tuottaa vuosittain 20 miljoonaa tonnia jätettä, josta suurin osa on lantaa (17-18 miljoonaa tonnia). Lisäksi syntyy 12 000 tonnia erilaista muovijätettä, esimerkiksi pyöröpaalien kiristekalvoja ja paalinaruja. Niin sanottua eläinjätettä syntyy maatiloilla kuolleista eläimistä vuosittain 10 miljoona kiloa. Turkistarhauksessa ruhoja syntyy 25-30 miljoonaa kiloa. Tavallisesti ruhot poltetaan, haudataan tai kompostoidaan tai niistä valmistetaan rehua eläimille, joita ei käytetä elintarviketuotantoon.
Lähteet:
Worldwatch-instituutti: Maailman tila 2006. Gaudeamus 2006
Maarit Puumala ja Juha Grönroos (toim.), 2004: SY708 Kotieläintalouden ympäristökuormituksen vähentäminen - Toimenpiteiden kustannukset ja toimivuus